O Programa de Pesquisa em Diferenciação Celular (PPDC) tem como objetivo usar uma abordagem evolutiva para estudar e compreender os processos celulares que estruturam e promovem o funcionamento dos animais, buscando aplicar estes conhecimentos na melhoria da qualidade de vida da sociedade. 

O programa é composto por 7 professores pesquisadores, renomados internacionalmente, com respeitada produção científica em diferentes modelos experimentais. 

A professora Cláudia Mermelstein estuda como diferentes vias de sinalização celular atuam durante a diferenciação de células musculares esqueléticas de vertebrados, utilizando principalmente o modelo do embrião de galinha. Seus resultados têm mostrado a participação das vias de Wnt/beta-catenina, Sonic Hedgehog e Notch durante a miogênese. 

O Professor Dr. Renato Rozental coordena o projeto inovador de implementação, na rede pública de saúde, do uso da impressão 3D para fabricação de próteses ósseas em cranioplastia, bem como o uso da hipotermia no procedimento inicial para tratamento de traumas do sistema nervoso central. 

O Professor João Menezes é neurocientista e está envolvido nos estudos da fisiologia cerebral. 

O Professor Manoel Costa estuda a miogênese durante o desenvolvimento de embriões de peixe zebra, um modelo de vertebrado muito estudo nos últimos anos. No seu trabalho ele utiliza técnicas inovadoras de microscopia óptica de fluorescência. 

A professora Sandra König atua na área de Oncobiologia com ênfase nos eventos celulares e moleculares que acompanham a iniciação e progressão tumoral, em particular no modelo de câncer de mama. 

A professora Morgana Teixeira Lima Castelo Branco estuda a imunologia celular tumoral, com particular ênfase em linfomas gástricos e Doença Inflamatória Intestinal. 

Muito simples como organismo, posicionado na base evolutiva dos animais, está o grupo das esponjas (Porífera), que é o modelo de estudo do Professor Cristiano Coutinho. Seu trabalho traça um paralelo entre câncer, metástase e origem da organização multicelular animal. O Professor Cristiano Coutinho também investiga o crescimento, estresse e a morfogênese durante a regeneração de esponjas, visando a produção de biomassa para alimentar o setor farmacêutico e/ou biomonitoramento ambiental.